Phortail est assez complet pour être utilisé tel quel, mais vous pouvez ajouter ou retirer des fonctions ou simplement le personnaliser.

La première personnalisation s'effectue dans les parties "configuration générale" et "configuration du site" de la zone d'administration du site.

Vous arrivez dans un formulaire où il est possible de préciser le nom du site, de le décrire, de changer son logo, d'y mettre les mots clés, son URL, de préciser le nombre de news s'affichant en page d'accueil, le nom du webmaster, son adresse email et son N° ICQ (obsolète), et votre pseudo de connexion. Vous pouvez changer le nom des sections, c'est à dire, le titre des boîtes latérales et des liens de la barre de navigation, vous pouvez choisir la couleur des textes, des titres, des liens, du fond de la page, des boîtes, des titres, du forum, du livre d'or, puis la taille et la police des textes. Vous pouvez ajouter, retirer ou déplacer des fonctions et vous pouvez choisir le thème de présentation (ou skin).

Si vous ne trouvez pas la couleur que vous souhaitez dans la palette de couleur mise à votre disposition dans la zone d'administration, vous pouvez utiliser un logiciel tel que Paint.net ou Pinta.